Die Forschungschwerpunkte des Mathematischen Instituts umfassen sowohl anwendungsorientierte Themen wie Angewandte Biomathematik, Bewertung von Umweltauswirkungen, Stochastische Prozesse und wasserwirtschaftliche Statistik, als auch grundlagenorientierte Untersuchungen auf den Gebieten Algebra, Analysis, Topologie, Dynamische Systeme und Fraktale Geometrie, Zahlentheorie und Mathematische Logik.