790442 Analysis of high-throughput sequencing data for AgriGenomics (in Eng.)


Art
Vorlesung und Übung
Semesterstunden
2
Vortragende/r (Mitwirkende/r)
Dohm, Juliane , Himmelbauer, Heinz
Organisation
Angeboten im Semester
Wintersemester 2021/22
Unterrichts-/ Lehrsprachen
Englisch

Lehrinhalt

This course will give an overview on next-generation sequencing data, focussed on Illumina and Pacific Biosciences technologies. Students will get familiar with data file formats, quality filtering, mapping of reads, de novo genome assembly, variant discovery, data visualization, and others. Analysis strategies will be explored using real data sets.

Inhaltliche Voraussetzungen (erwartete Kenntnisse)

Linux knowledge for data analysis is required which can be obtained by attending the course “Data analysis skills for AgriGenomics students” or “Essentials for bioinformatics data analysis”.

Lehrziel

Students will get familiar with different applications of high-throughput sequencing technologies and data analysis strategies.
Noch mehr Informationen zur Lehrveranstaltung, wie Termine oder Informationen zu Prüfungen, usw. finden Sie auf der Lehrveranstaltungsseite in BOKUonline.