790383 Bioinformatics: Selected aspects (in Eng.)

Art
Vorlesung und Übung
Semesterstunden
3
Vortragende/r (Mitwirkende/r)
Kreil, David Philip
Organisation
Angeboten im Semester
Wintersemester 2024/25
Unterrichts-/ Lehrsprachen
Englisch
Lehrinhalt

Genexpressionsanalyse, Grenzen von Next-Generation-Sequencing, Funktionsprinzipien von DNA-Mikroarrays.

Fragen des experimentellen Designs, das Wechselspiel von Experiment und Inferenz, aktuelle technische Entwicklungen und Probleme werden ebenso behandelt wie die Grundsätze der computergestützten Auswertung, von Rohdaten-Transformation und statistischen Tests zu anspruchsvolleren Modellen. Analysen inkludieren funktionale Aspekte. Gelerntes wird schließlich ausführlich an Beispielen selber angewandt, welche aktuellen Entwicklungen und die Interessen der Teilnehmer widerspiegeln.

Die LV wird zur Gänze auf Englisch abgehalten.

Wir freuen uns auf Ihre Teilnahme!

Kursüberblick auf http://bioinf.boku.ac.at/newweb/pages/SemLec.php
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Inhaltliche Voraussetzungen (erwartete Kenntnisse)

Eine Vertrautheit mit computergestützten Methoden und Konzepten der Datenanalyse wird für Hörer hilfreich sein. Von allen Teilnehmern werden Grundkenntnisse in der Benutzung der Sprache "R" zur statistischen Datenanalyse erwartet. Boku-Studierenden empfehlen wir sehr, die LV "Statistics with R" im selben Semester oder früher zu belegen.
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Lehrziel

Die Blockveranstaltung führt ein in die massiv-parallele Analyse von Gen-Transkript-Expression durch DNA-Mikroarrays, so daß Studierende dann effektive Experimente identifizieren und entwerfen können, Signaldaten auswerten können, um technische Artefakte zu identifizieren und kompensieren, und schlußendlich robuste Muster von biologischer Relevanz entdecken, und deren statistische Signifikanz und funktionelle Bedeutung abschätzen können. Schließlich können die Studierenden Ihre Fähigkeiten in der Analyse eines publizierten Datensets oder an einer aktuellen Herausforderung aus ihrer eigenen Forschung testen.
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Noch mehr Informationen zur Lehrveranstaltung, wie Termine oder Informationen zu Prüfungen, usw. finden Sie auf der Lehrveranstaltungsseite in BOKUonline.