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Das Stadlmann Lab

In unserer Arbeitsgruppe erforschen wir die grundlegenden biologischen Funktionen der Proteinglykosylierung – eines Prozesses, bei dem Zuckermoleküle an Proteine angehängt werden. Dieser Mechanismus steuert zentrale zelluläre Funktionen wie Signaltransduktion, Zelladhäsion und den intrazellulären Transport.

Mit der Entwicklung fortschrittlicher Glycoproteomic-Technologien analysieren wir die dynamische und positionsspezifische Glykosylierung von Proteinen. Ziel ist es, zu verstehen, wie diese Modifikationen die Funktion von Proteinen beeinflussen und wie sie die Wechselwirkungen zwischen Zellen und ihrer Umgebung vermitteln. Durch die Entschlüsselung der Komplexität des Glykoproteoms möchten wir grundlegende biologische Fragen beantworten, etwa wie die Glykosylierung die zelluläre Kommunikation, Entwicklung und Anpassung in verschiedenen Systemen reguliert.

Neben unserer Forschung legen wir großen Wert auf die Aus- und Weiterbildung. Unser Labor verstehen wir als einen Ort, an dem praktische Fähigkeiten in biochemischen Arbeitsmethoden vermittelt werden. Studierende haben die Möglichkeit, im Rahmen neugiergetriebener Forschungsprojekte praktische Laborerfahrung zu sammeln. Durch die Begleitung ihrer eigenen Projekte fördern wir ihre Entwicklung zu unabhängigen und kreativen Forschenden. 

Gerne bieten wir die Möglichkeit, eigene Ideen im Rahmen von Projekten im Labor umzusetzen – entweder allein oder in Zusammenarbeit mit anderen Studierenden. Projektvorschläge für Bachelor- und Masterarbeiten sind jederzeit willkommen und werden gemeinsam mit den Studierenden weiterentwickelt.

WiSe25 - Biochemische Übungen 1

Mit der Änderung des Curriculums für das Bachelorstudium LBT werden die Biochemischen Übungen 1 ab dem Wintersemester 2025 in überarbeiteter Form (4ECTS) angeboten. Die hierfür erforderlichen Planungen befinden sich derzeit in vollem Gange. Bitte beachten Sie, dass die hier bereitgestellten Informationen unter Vorbehalt stehen und lediglich den aktuellen Planungsstand widerspiegeln. Verlässliche Informationen und Kurspläne werden voraussichtlich Anfang September auf BOKUlearn verfügbar sein.


Ablauf:

  1. Laboreingangsprüfung: 

    Die Anmeldung zu und Teilnahme an den praktischen Übungen ab dem Wintersemester 2025 (WiSe25) ist nur nach erfolgreichem Abschluss einer Laboreingangsprüfung möglich.

    Die Themenbereiche und der Prüfungsumfang der Laboreingangsprüfung werden im Vergleich zu den bisherigen „Rechentests“ der Biochemischen Übungen stärker an die tatsächlichen Lehrinhalte des praktischen Übungsteils angepasst. Ziel der Laboreingangsprüfung ist es, sicherzustellen, dass die Teilnehmenden sich mit den wichtigsten theoretischen und praktischen Aspekten der Laborübungen vertraut gemacht haben. Genauere Informationen und Unterlagen werden Anfang September auf BOKUlearn verfügbar sein.

    Die ersten Termine für die Laboreingangsprüfung können aufgrund studienrechtlicher Vorgaben erst ab Beginn des Wintersemesters 2025 (01.10.2025) angeboten werden. Die genauen Prüfungstermine werden voraussichtlich Anfang September auf BOKUonline und BOKUlearn bekannt gegeben.

     

  2. Biochemische Übungen 1 – Organisation und Ablauf

    Die Biochemischen Übungen 1 werden weiterhin in Form von „Kursen“ abgehalten. Jeder Kurs umfasst 12 tatsächliche Laborarbeitstage, was in der Regel einem Zeitraum von drei Wochen entspricht. 

    Die Studienabteilung der BOKU hat einen empfohlenen „Stundenplan“ für das Bachelorstudium LBT erstellt. Um Überschneidungen mit anderen Pflichtlehrveranstaltungen des 5. Semesters zu vermeiden, findet der praktische Übungsbetrieb im Wintersemester (WiSe) von Montag bis Donnerstag jeweils von 11:00 bis 16:00 Uhr statt.

    Die genauen Lehrinhalte sowie die zeitlichen und logistischen Abläufe der praktischen Übungen werden derzeit intensiv ausgearbeitet. Ein verlässlicher, schematischer Kursablauf wird voraussichtlich Anfang September auf BOKUlearn veröffentlicht. Hinweis: Die aktuelle Planungsgrundlage (Ablaufschema) steht unter Vorbehalt.

  3. Protokollierung und Dokumentation

    Ab dem Wintersemester 2025 (WiSe25) wird die Protokollierung der Übungen vereinfacht. Studierende reichen nur noch zwei Dokumente ein:

    • Einen Endbericht („Protokoll“) über den gesamten Kursverlauf (Tag 1 bis Tag 12), der folgende Inhalte umfasst: Zielsetzung, Einleitung, Durchführung, Darstellung der experimentellen Ergebnisse, Datenbetrachtung, Diskussion und Zusammenfassung. Dieser Bericht ist in elektronischer Form abzugeben.

      UND

    • Ein Laborjournal, das handschriftlich und GLP-konform (Good Laboratory Practice) geführt wird.

      Details zu den Anforderungen an den Endbericht und das Laborjournal werden Anfang September auf BOKUlearn bereitgestellt.

  4. Aktuelle geplante Kursterminen WiSe25 (!! unter Vorbehalt !!):

    Kurs 1: 20.10. - 06.11.2025

    Kurs 2: 10.11. - 28.11.2025

    Kurs 3: 01.12. - 19.12.2025

 

 

Ausgewählte Publikationen der AG Stadlmann

  1. Helm J, Mereiter S, Oliveira T, Gattinger A, Markovitz DM, Penninger JM, Altmann F, Stadlmann J., Non-targeted N-glycome profiling reveals multiple layers of organ-specific diversity in mice Nat Commun. 2024 Nov 9;15(1):9725. doi: 10.1038/s41467-024-54134-z.
  2. Stadlmann J, Taubenschmid J, Wenzel D, Gattinger A, Dürnberger G, Dusberger F, Elling U, Mach L, Mechtler K, Penninger JM., Comparative glycoproteomics of stem cells identifies new players in ricin toxicity Nature. 2017 Sep 28;549(7673):538-542. doi: 10.1038/nature24015. Epub 2017 Sep 20.
  3. Taubenschmid J, Stadlmann J, Jost M, Klokk TI, Rillahan CD, Leibbrandt A, Mechtler K, Paulson JC, Jude J, Zuber J, Sandvig K, Elling U, Marquardt T, Thiel C, Koerner C, Penninger JM., A vital sugar code for ricin toxicity Cell Res. 2017 Nov;27(11):1351-1364. doi: 10.1038/cr.2017.116. Epub 2017 Sep 19.
  4. Stadlmann J, Hoi DM, Taubenschmid J, Mechtler K, Penninger JM., Analysis of PNGase F-Resistant N-Glycopeptides Using SugarQb for Proteome Discoverer 2.1 Reveals Cryptic Substrate Specificities Proteomics. 2018 Jul;18(13):e1700436. doi: 10.1002/pmic.201700436. Epub 2018 Jun 10.
  5. Wirnsberger G, Zwolanek F, Stadlmann J, Tortola L, Liu SW, Perlot T, Järvinen P, Dürnberger G, Kozieradzki I, Sarao R, De Martino A, Boztug K, Mechtler K, Kuchler K, Klein C, Elling U, Penninger JM., Jagunal homolog 1 is a critical regulator of neutrophil function in fungal host defense Nat Genet. 2014 Sep;46(9):1028-33. doi: 10.1038/ng.3070. Epub 2014 Aug 17.
  6. Hagelkruys A, Wirnsberger G, Stadlmann J, Wöhner M, Horrer M, Vilagos B, Jonsson G, Kogler M, Tortola L, Novatchkova M, Bönelt P, Hoffmann D, Koglgruber R, Steffen U, Schett G, Busslinger M, Bergthaler A, Klein C, Penninger JM., A crucial role for Jagunal homolog 1 in humoral immunity and antibody glycosylation in mice and humans J Exp Med. 2021 Jan 4;218(1):e20200559. doi: 10.1084/jem.20200559.
  7. Raglow Z, McKenna MK, Bonifant CL, Wang W, Pasca di Magliano M, Stadlmann J, Penninger JM, Cummings RD, Brenner MK, Markovitz DM., Targeting glycans for CAR therapy: The advent of sweet CARs Mol Ther. 2022 Sep 7;30(9):2881-2890. doi: 10.1016/j.ymthe.2022.07.006. Epub 2022 Jul 12.
  8. Capraz T, Kienzl NF, Laurent E, Perthold JW, Föderl-Höbenreich E, Grünwald-Gruber C, Maresch D, Monteil V, Niederhöfer J, Wirnsberger G, Mirazimi A, Zatloukal K, Mach L, Penninger JM, Oostenbrink C, Stadlmann J., Structure-guided glyco-engineering of ACE2 for improved potency as soluble SARS-CoV-2 decoy receptor Elife. 2021 Dec 20;10:e73641. doi: 10.7554/eLife.73641.
  9. Yan S, Vanbeselaere J, Ives C, Stenitzer D, Nuschy L, Wöls F, Paschinger K, Fadda E, Stadlmann J, Wilson IBH. Glycoproteomic and Single-Protein Glycomic Analyses Reveal Zwitterionic N-Glycans on Natural and Recombinant Proteins Derived From Insect Cells. Mol Cell Proteomics. 2025 May 5;24(6):100981. doi: 10.1016/j.mcpro.2025.100981. Epub ahead of print. PMID: 40334746; PMCID: PMC12166434.
  10. Walcher S, Hager-Mair FF, Stadlmann J, Kählig H, Schäffer C., Deciphering fucosylated protein-linked O-glycans in oral Tannerella serpentiformis: Insights from NMR spectroscopy and glycoproteomics Glycobiology. 2024 Dec 10;34(12):cwae072. doi: 10.1093/glycob/cwae072.