Metabolomics von Pflanzen
Metabolomics ist eine junge, aufstrebende Forschungsdisziplin, die darauf abzielt, durch vergleichende Untersuchungen herauszufinden wie die Gesamtheit der Stoffwechselprodukte eines Organismus durch gezielte (a)biotische Störungen beeinflusst wird.
Wir verwenden hauptsächlich LC-MS und GC-MS basierte Methoden für die Entwicklung innovativer Metabolomics-Abläufe. Ein Schwerpunk unserer Arbeiten liegt dabei auf dem systematischen Einsatz von In-vivo Stabilisotopen-Techniken (13C, 15N, 34S) für die verbesserte Metabolom-Annotierung, genauere metabolomweite Quantifizierung, Substanzstruktur-Charakterisierung und die Entwicklung neuer Software für die automatisierte Datenauswertung.
Unsere Forschung basiert auf enger interdisziplinärer Zusammenarbeit mit Partnern aus der Bioinformatik, Molekularbiologie oder den Pilz- und Pflanzenwissenschaften.
Die entwickelten Methoden werden derzeit angewendet um das Metabolom und die Interaktion filamentöser Pilze, Bakterien und Pflanzen zu untersuchen.
Forschungsschwerpunkte
- Entwicklung und Anwendung von Metabolomics-Methoden
- Studium von Mikroben, Pflanzen & deren Interaktion
- Analytik sek. (LC-HRMS), prim. (GC-MS) & flüchtiger (HS-GC-MS) Substanzen
- Aufreinigung, Isolierung & Charakterisierung bioaktiver Substanzen
- Qualitätssicherung im Bereich Metabolomics
Ausstattung
- Voll ausgestattete Labors zur Probenaufarbereitung
- HPLC-HRMS(/MS) - Orbitrap MS
- 3 x QTrap MS/MS mit UPLC
- automatisierte HS-SPME-GC(EI/CI)-MS
- GC-MS zur Online-Derivatisierung
- HPLC-DAD mit Fraktionskollektor
- Präparative HPLC-DAD/ELSD
- Datenbanken und (selbstentwickelte) Software zur Datenauswertung
Kontakt: Univ.Prof. Rainer Schuhmacher Weiterführende Informationen: Metabolomics